ST258 K. pneumoniae является преобладающей причиной человеческих инфекций среди бактерий, классифицированных как стойкий к карбапенеме Enterobacteriaceae (CRE), которые ежегодно убивают приблизительно 600 человек в Соединенных Штатах и вызывают отвращение у тысяч больше. Большинство инфекций CRE появляется в больницах и заведениях, предоставляющих долгосрочный уход, среди пациентов, которые уже ослаблены несвязанной болезнью или подверглись определенным медицинским процедурам. В новом исследовании ученые из Национального Института NIH Аллергии и Инфекционных заболеваний (NIAID) и их коллег упорядочили полные геномы ST258 K. pneumoniae напряжения, собранные от двух пациентов в больницах Нью-Джерси.
Сравнивая эти справочные геномы с последовательностями генов еще от 83 клинических ST258 K. pneumoniae изолирует, ученые нашли, что напряжения разделились широко на две отличных группы, каждого с его собственной эволюционной историей. Дальнейший анализ показал, что большинство различий между этими двумя группами происходит в единственной «горячей точке» генома, содержащего гены, которые производят части внешней оболочки бактерии.
Следователи планируют далее учиться, как эти генетические различия могут затронуть способность бактерии уклониться от человеческой иммунной системы.Результаты от этого исследования подчеркивают богатство информации, которая может быть получена от упорядочивающего генома.
Они также демонстрируют важность упорядочивания к наблюдению и точному отслеживанию бактериального распространения. Учитесь среди сотрудников были NIAID-финансируемые ученые из медицинской школы-Университета Ратджерса Научно-исследовательского института и Нью-Джерси Здравоохранения, а также исследователи из Западного резервного университета Кейза, Хьюстонской Методистской Системы Научно-исследовательского института и Больницы и Горных Лабораторий Рокки NIAID, где сравнительный упорядочивающий геном произошел.